Rcpp のバックアップ(No.3) - アールメカブ

アールメカブ


Rcpp のバックアップ(No.3)


Rの備忘録

dirk.eddelbuettel Rcpp

_ DataFrame? 作成

#include "Rcpp.h"
RcppExport SEXP testDF (){

 Rcpp::IntegerVector v = Rcpp::IntegerVector::create(1,2,3);
 std::vector<std::string> str(3);
    str[0] = "A"; str[1] = "B"; str[2] = "C";
    return Rcpp::DataFrame::create(Rcpp::Named("Var1", v), 
                 Rcpp::Named ("Var2", s),
                 Rcpp::Named("stringsAsFactors", false )); 
// あるいは 
     return Rcpp::DataFrame::create(Rcpp::Named("VAR1") =  v,
                 Rcpp::Named ("VAR2") =  s,  
                 Rcpp::Named("stringsAsFactors") = false ); 	 
}

_ CharacterVector?

RcppExport SEXP testChar (SEXP a, SEXP b){
  Rcpp::CharacterVector xa (a);
  Rcpp::CharacterVector xb (b);

ここで以下はコンパイラを通らない

std::string sxa = xa[0];

以下のようにしないと行けない

  std::string sxa;
  sxa = xa[0];
  std::string sxb;
  sxb = xb[0]; 

_ rcpp のサンプル

Windows 7(64bit) 上の R-2.12.0 環境で,Rcpp_sample.cpp を以下のMakevars を用意.

PKG_CXXFLAGS=$(shell Rscript -e "Rcpp:::CxxFlags()")
PKG_LIBS=$(shell Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()")

してコマンドプロンプトから素直に

R CMD SHLIB Rcpp_sample.cpp
   http://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#using-pathnames
g++ -shared -s -static-libgcc -o  Rcpp_sample.dll tmp.def 
  Rcpp_sample.cpp C:/Users/ishida/Documents/R/win-library/2.12/Rcpp/lib/i386/libRcpp.a
-LC:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/bin/i386 -lR

とすると i386 が呼ばれる.確かに

Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()
C:/Users/ishida/Documents/R/win-library/2.12/Rcpp/lib/i386/libRcpp.a

となっている.が,こっちを呼んで欲しい

Rscript --arch x64 -e "Rcpp:::LdFlags()
C:/Users/ishida/Documents/R/win-library/2.12/Rcpp/lib/x64/libRcpp.a

やむなく

PKG_LIBS = C:/Users/ishida/Documents/R/win-library/2.12/Rcpp/lib/x64/libRcpp.a 

あるいは

PKG_LIBS = -LC:/Users/ishida/Documents/R/win-library/2.12/Rcpp/lib/x64/ -lRcpp

と修正し

R --arch x64 CMD SHLIB Rcpp_sample.cpp

と実行.

dyn.load("Rcpp_sample.dll")