日録2009年8月のバックアップ(No.40)

過去の日録

Lattice Multivariate Data Visualization with R

_ 2009 年 8 月 26 日（水）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- S社から新規の二冊について連絡あり．
午後．コンビニ．
- 久しぶりでドイツ語の本を読む．Methode der kleinsten Fehlerquadrate と出てきた．前後関係から最小自乗法のことらしい．

↑

_ 2009 年 8 月 25 日（火）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R-2.9.2がリリースされたので、RMeCab, R2MeCab をアップデート。ついでに，docNgram2() 関数と docNgramDF() 関数に残っていたバグを修正しておく．
- RCaBoCha作成のため boost_1_35 をUbuntuに入れる。
- さらに Windows XP (on Ubuntu 9.04) に Boost-1_33_1 を入れて，jam を使ってコンパイルを始めるが，これがなかなか終わらん．
午後
- iMac にも Boost をインストール．こっちは，正しい？手順がわからんので，上記 XP でのコンパイル方法を踏襲する．
- boostをインストールしたので，RCaBoCha もヴァージョンアップする．こちらは機能の追加や修正は行っていない．
- 舟尾暢男先生(著) を献本頂いた．どうもありがとうございます．

↑

_ 2009 年 8 月 24 日（月）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- サーバーを再稼働
- 週末 RMeCab の NgramDF() 関数と NgramDF2() 関数の出力が一致していないとの指摘を受けた．研究室引っ越し作業が一段落したので，ソースを見直すと，変数名を間違えるという，とんでもないポカをしていた．
- 今日明日，Rの新しいバージョンR-2.9.1 が出るのは分かっているのだが，R-2.9.1用の RMeCab バイナリを作成して公開しておく．
午後。第2章食堂。Special。メンチカツ。ほかにも何かあったような気がするが忘れた。
- RMeCab 0.83 を公開。これは R-2.9.1 で作成したので、つい今しがた release された R-2.9.2 用のバイナリは、また別に作成しなければいけない。

↑

_ 2009 年 8 月 23 日（日）晴

午後
- 11:30 - 18:15 研究室移転作業に立ち会う．
- 業者任せかと思いきや，意外にも，あれこれ荷物運びをすることがあり，かなり消耗する．

↑

_ 2009 年 8 月 22 日（土）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- を終える
午後
- 夕方からサーバーを落とす．IPを変更し，DNSの設定も変える．

↑

_ 2009 年 8 月 21 日（金）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- S 社と R Through Excel についてやりとり．
午後．第二食堂ランチ．レンコンメンチカツ？

↑

_ 2009 年 8 月 20 日（木）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- を続ける．サンプルの解析は JAGS + rjags で実行しているが，データは WinBUGS の形式で与えられているので，データを取り出すためだけに Wine を起動するのが，面倒．
- 上記の本は，コード部分の解説がまるで訳されていない．やっぱり訳すべきだろう．ところが，翻訳掲載のコードコメントの内容が変である．原著者サイトからダウンロードしたコードと照らし合わせてみると，後者の方では修正されている．翻訳に掲載されたコードと，そのコメントは信用しない方がよさそう．
午後．第2食堂スペシャル．チキン
- R Through Excel を眺める．図がめちゃくちゃ多い．

↑

_ 2009 年 8 月 19 日（水）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 朝いちでネットワーク不通
- を読む．
午後
- 暑いさなか，電気量販店にヘッドフォンを行く．

帰ってからを続ける．

↑

_ 2009 年 8 月 18 日（火）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- WinBUGS では2変量正規の分布のデータを与える場合，data に対して，単純にリストを二つ与えればいいようだが，JAGSでの与え方がよく分からない．それぞれ別々に与えて分析する手もあるが，同時に実行したい．
- WinBUGS にあるスカラー値を返す rank(), ranked() も JAGS では挙動が違う．WinBUGS 1.4 マニュアルによれば

rank(v, s)  # number of components of v less than or equal to v_s
ranked (v, s)  # the s_th smallest component of v

午後
- 15:00から16:30までテキストマイニングに関する会議

↑

_ 2009 年 8 月 17 日（月）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- s社に書類送付．
午後．第２食堂．鳥のフリッター？
- rjags のモデルで初期値に0.5を与えたら

d = c(0.5, 0.5)

エラーが出た．

Current value is inconsistent with data

モデル的には問題ないはずなのになぁ，と思って，何気なく以下のように変更したら通った．

d = c(.5, .5)

↑

_ 2009 年 8 月 16 日（日）晴

特に変わったことなし
- 充電

↑

_ 2009 年 8 月 15 日（土）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 担当すると決めたわけではないが，Bayesian Computation with R を少し訳してみる．

↑

_ 2009 年 8 月 14 日（金）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 引き続きを読む．
午後
- R 2.9.2 Scheduled for August 24, 2009　という通知が来た．またバージョンアップか．
- Bayesian Computation with R を改めて眺める．読むだけでは感触がつかめないので，少し訳したりしている．
- R Through Excel も出たようだ．これは，さくっとできそう．

↑

_ 2009 年 8 月 13 日（木）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 研究室の整理もおおむね終わったので，昨日の片付けをして，ラボに向かう．
- Dynamic Objective-Cのメソッドパッシングというのがよく分からないので，Dynamic Objective-C を読む．メソッドパッシングという言葉自体は出てこないのだが，｢メソッドとは何か｣以降に詳しく書いてあって，非常にわかりやすい．
  - 関連して、こんなページ見つけた
午後．近くのスーパーで弁当．
- を読む．これは和書の中では，初心者にも非常に取っつきやすい本だろう．ただ Ubuntu/Mac 上で rjags を使っているものからすると，サイトのデータは使いにくい．WinBUGS のデータ形式なのである．それに，掲載コードに少し間違いがある．
- さらに rjags 独特の面倒もある．WinBUGS なら，以下のように書けるが，rjags では Y　が再定義されたと怒られる．
```
Y [i] <- log( C3 [i] + 1)
Y [i] ~ dnorm (mean [i] , prec)
```
  なので，これを回避すべく，たとえばモデル定義で

data = list( LONG = dat$LONG, LAT = dat$LAT, C3 = dat$C3, 
             Y = log(dat$C3 + 1 )),

などとしなければならない．そのほか，任意のxに対する予測値yをシミュレートするにも，若干コードを書き直す必要がある．

↑

_ 2009 年 8 月 12 日（水）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 研究室の片付けを今日中に終えるべく，途中，水を飲むだけで，夕方17時までぶっ通しで作業する．
午後
- 17:00 作業終了．いくつかの書類を整理しなければならないが，まあ，95%　作業が完了した．
- 阿波踊りが始まったので，18時過ぎると街が混み合ってくる．その前に自宅に帰る．

↑

_ 2009 年 8 月 11 日（火）快晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- いよいよ引っ越しも佳境に入ってきた
- サーバーを旧研究室に仮移転
午後．工学部食堂．スペシャル．カツの卵とじ？

↑

_ 2009 年 8 月 10 日（月）大雨

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 総合科学部と工学部を挟む道路が水没してしまっており，ラボへ渡ることができない．
- 仕方ないので，移転の準備をする．
午後．工学部食堂でスペシャル．味噌カツ．さすがに誰もいない．

↑

_ 2009 年 8 月 9 日（日）大雨

　大雨で，かつ蒸し暑い．

↑

_ 2009 年 8 月 8 日（土）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- オープンキャンパス準備
午後
- 　オープンキャンパス
- Apple社の担当者を交えて慰労会．

↑

_ 2009 年 8 月 7 日（金）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 　「文系数学」最後の授業
午後．来客と食事
- iPhone関連企画
- 明日のオープンキャンパス準備

↑

_ 2009 年 8 月 6 日（木）雨

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 移転に向けた作業を少しずつ行う
- 出版社が送ってきてくれた原書に目を通す．
午後
- オープンキャンパス準備

↑

_ 2009 年 8 月 5 日（水）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 移転に向けた作業を少しずつ行う
- 　iPhone関連の作業を同僚と続ける．別の同僚がサーバーやWebの管理をしてくれるはずだったのだが，実はサーバー等の知識がないことが判明し，結局，私がやった．
午後
- 出版社から相談のメール．
- 　充電

↑

_ 2009 年 8 月 4 日（火）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 朝から，インストールしたばかりの Ubuntu 9.04の設定。開発環境を入れ，TeX を入れ，R　を入れ，MeCab? を入れ，VMpalyer を入れ，次に VMPlayer 上に XP, 同じく開発環境を整備する．
午後

↑

_ 2009 年 8 月 3 日（月）曇・雨

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 出版社と新しい本についてやりとり．
- Ubuntu 9.04 をインストールしようとしたら，CD　が壊れていた．．
午後．Apple社の方と面談の予定．その前にK氏と食事に出る．
- Ubuntu + USB無線Lan子機 + WPA2-PSK(AES)認証がうまくいかない。USB 機器は認識しており、周囲の無線も拾っているので、認証の問題だと思うのだが、GUI無線Manager　や wpa_supplicant.config など、あれこれ試すも、接続に至らない。

etc/network/interfaces

auto lo
iface lo inet loopback

auto rausb0
iface rausb0 inet dhcp
wpa-driver wext
wpa-conf /etc/wpa_supplicant/wpa_supplicant.conf

wpa_supplicant.conf

ctrl_interface=/var/run/wpa_supplicant
ap_scan=2
network={
	ssid="hogehoge"
	#psk="hogehoge"
       psk=123456789...abcdef1234
	key_mgmt=WPA-PSK
	proto=RSN
	pairwise=CCMP
	group=CCMP
}

WEP接続にしてしまえという誘惑に駆られる。

それにしても暗号化の種類、多すぎる。ここに手短にまとまっていた。

↑

_ 2009 年 8 月 2 日（日）晴

自宅

↑

_ 2009 年 8 月 1 日（土）曇・雨

05:30 起床
07:00 研究室着

午前
- 大学の雑用を片付ける

アールメカブ

日録2009年8月 のバックアップ(No.40)

_ 2009 年 8 月 26 日（水）晴

_ 2009 年 8 月 25 日（火）晴

_ 2009 年 8 月 24 日（月）晴

_ 2009 年 8 月 23 日（日）晴

_ 2009 年 8 月 22 日（土）晴

_ 2009 年 8 月 21 日（金）晴

_ 2009 年 8 月 20 日（木）晴

_ 2009 年 8 月 19 日（水）晴

_ 2009 年 8 月 18 日（火）晴

_ 2009 年 8 月 17 日（月）晴

_ 2009 年 8 月 16 日（日）晴

_ 2009 年 8 月 15 日（土）晴

_ 2009 年 8 月 14 日（金）晴

_ 2009 年 8 月 13 日（木）晴

_ 2009 年 8 月 12 日（水）晴

_ 2009 年 8 月 11 日（火）快晴

_ 2009 年 8 月 10 日（月）大雨

_ 2009 年 8 月 9 日（日）大雨

_ 2009 年 8 月 8 日（土）晴

_ 2009 年 8 月 7 日（金）晴

_ 2009 年 8 月 6 日（木）雨

_ 2009 年 8 月 5 日（水）晴

_ 2009 年 8 月 4 日（火）晴

_ 2009 年 8 月 3 日（月）曇・雨

_ 2009 年 8 月 2 日（日）晴

_ 2009 年 8 月 1 日（土）曇・雨

日録2009年8月のバックアップ(No.40)