日録2009年1月のバックアップ(No.27)

過去の日録

_ 2009年 1月 17日 (土) 晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- OS X 11.5.6 Leopard powerpc-apple-9.6.0 という環境で RMeCabが動作しないという報告を頂いた．sessionInfo()に
```
> sessionInfo()
R version 2.8.1 (2008-12-22)
powerpc-apple-darwin9.6.0
```
  darwin9.6.0とでるそうなのだが，どういう環境なんだろうか．私の手元のOS X 11.5.6 Leopard build-type i386-apple-darwin9.6.0にインストールした R の sessionInfo()情報は
```
> sessionInfo()
R version 2.8.1 (2008-12-22)
i386-apple-darwin8.11.1 
```
  となるのだが．CRANからダウンロードしたバイナリではないということだろうか？
- 慣れないOSいじりは疲れた．他の仕事に回ろう．
午後．
- Lattice 翻訳．
  - 著者の環境は，私と同じ Ubuntu (Debian)+ESS らしいが，一応，Mac 版 R や Windows 版 R でも確認しておこう．
- 明日はセンタ試験業務で，明後日は統数研に出張なので，今日中に少しでも仕事を進めておきたい．
- 3D 画像を説明する文章が延々と続く．図を見れば簡単に分かることだが，文章にすると非常に分かりづらい．わざわざ分かりにくくしている感さえある．

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_ 2009年 1月 16日 (金) 晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- Lattice 翻訳．
午後．弁当を買ってきてすます
- 二つ以上の変数がある場合データが mulitvariate というのに対して，グラフィックスの表す次元が 3 次元を超える場合をhytervariate という．Cleveland の用語．そのまま「超次元」と訳しておく．
- eps 画像などでおなじみの bounding box だが，日本語にしようがないな．
- "data are centered and scaled" という表現だが，要するに平均を引いて標準偏差でわる標準化 normalizedのことだが，わざわざ「中心化」して「尺度化」すると訳すべきか．

↑

_ 2009年 1月 15日 (木) 晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- ppc で，パッケージ全体ではなく，ソースファイルのコンパイルを行ってみると，ちゃんとライブラリが作成される．ところが，読み込みはできない．実行時の ppc 版 mecab ライブラリとのリンクがうまくいっていない．

$ otool -L Library/R/2.8/library/RMeCab/libs/ppc/RMeCab.so 
Library/R/2.8/library/RMeCab/libs/ppc/RMeCab.so:
       RMeCab.so (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
        /Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.8/Resources/lib/
    libR.dylib (compatibility version 2.8.0, current version 2.8.1)
       /System/Library/Frameworks/CoreFoundation.framework/
          Versions/A/CoreFoundation (compatibility version 150.0.0,
                current version 476.17.0)
       /usr/lib/libstdc++.6.dylib (compatibility version 7.0.0,
                current version 7.4.0)
       /usr/local/lib/libgcc_s.1.dylib (compatibility version 1.0.0, 
               current version 1.0.0)
       /usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0, 
              current version 111.1.3)

intel Mac ではこうなる

$ otool -L Rlibs/RMeCab/libs/i386/RMeCab.so 
Rlibs/RMeCab/libs/i386/RMeCab.so:
	RMeCab.so (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
	/usr/local/lib/libmecab.1.dylib (compatibility version 2.0.0,
              current version 2.0.0)
	/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.8/Resources/
            lib/libR.dylib (compatibility version 2.8.0,
               current version 2.8.1)
	/System/Library/Frameworks/CoreFoundation.framework/
          Versions/A/CoreFoundation (compatibility version 150.0.0, 
               current version 476.17.0)
	/usr/lib/libstdc++.6.dylib (compatibility version 7.0.0, 
               current version 7.4.0)
	/usr/local/lib/libgcc_s.1.dylib (compatibility version 1.0.0, 
               current version 1.0.0)
	/usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0,
              current version 111.1.3)

ppc における mecab ライブラリとのリンク方法の問題なので，ppc でのダイナミックリンクについて少し調べてみよう．

10:25-12:00 演習

午後
- ppc の対策は後回しにして，とりあえず目前の仕事を片付ける．
- 16:30 -18:00 会議
- 強引にppc版を作成

$ R CMD SHLIB RMeCab/src/RMeCab.cpp -dynamiclib 
           -L/usr/local/lib -lmecab
$  cp RMeCab/src/RMeCab.so 
          ~/Library/R/2.8/library/RMeCab/libs/ppc/
$ tar zcfv RMeCab_0.67.ppc.tgz RMeCab/

動作確認には ppc 実機が必要だが，作成は intel 版でも可能．

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_ 2009年 1月 14日 (水) 晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 仕事のピッチを上げねばならない．
午後． K氏と近くの定食屋へ．600円の定食の塩鮭が，今時珍しいことに，やたらとしょっぱい．
- 拝借した ppc Mac OS X Tiger でパッケージのコンパイル．これがなかなか手強い．まずは，あっさりと次の処置をするが，うまくいかない．

$ sudo gcc_select 3.3
$ export MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET=10.3
$ R CMD build --binary RMeCab

少し本腰を入れて取りかからなければならない．意外に手こずりそうで弱った．今，猛烈に忙しいのだ．．．

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_ 2009年 1月 13日 (火) 晴

07:30 起床
09:00 研究室着

午前
- あれこれ書類書き
午後．工学部Special400.韓国風唐揚げ？なるものとキャベツ千切り，味噌汁ご飯．キムチ味が何となくするということか．
- 演習．Rでカイ二乗検定

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_ 2009年 1月 12日 (月) 晴

07:30 起床
09:00 研究室着

午前
- Lattice 翻訳．
- 一時，雪が降る．
午後
- Lattice 翻訳．

↑

_ 2009年 1月 11日 (日) 晴

07:30 起床
一日整理など

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_ 2009年 1月 10日 (土) 晴

07:30 起床
09:00 研究室着

午前
- 雑用や来客が多く，仕事がはかどらない．少し焦ってきた．
- R_Latticeで原書のコードを改編しないと，掲載の図にならん．掲載の図はすべて device が postscript として作成されている．Sarkarに相談することにする．

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_ 2009年 1月 9日 (金) 曇

6:00 起床
07:30 研究室着

午前
- RMeCab について，Power PC で動作しないというご報告を複数頂いている．対処は簡単だと思うのだが，なにせ PPC 版 Mac が手もとにないので，とりあえず，借りる算段をつけないと，なにもできない．
  - MeCab? そのもののインストールも，PPC 版 Mac では問題があるらしい．こちらも早く確認したいのだが．
午後．来客と食事
- Lattice 翻訳に取りかかる．
- 午後，いろいろと来客．

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