日録2009年10月のバックアップの現在との差分(No.28)

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[[過去の日録]]


//#htmlinsert(amazonads)
// &htmlinsert(amazontext,asin=,text=); 

#ref(R_Lattice/lattice113.png)
[[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]]


//http://iphone.trafficgate.net/site_tour3.html
// http://iphone.trafficgate.net/wiki/


* 2009 年 10 月 31 日 （土曜） [#r5ff019f]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 米国 Apple から、PushNotification を利用可能にしたというメールが届く。2か月前に文句を送っていて、さんざんあれこれメールのやり取りをした挙句、ようやく。
- 午後
--　さっそく　Notification　を実装したアプリを試作してみる。Pushを送るにはサーバーを用意するのだが、実験なので、とりあえずローカルマシンに簡単な PHP コードを用意して送信してみる。
---　なるほど、これは便利。
--　歯医者。昨日詰めてもらったセメントが取れてしまった。

* 2009 年 10 月 30 日 （金曜） [#tae6b235]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 雑用に追われる
- 午後
-- 歯医者

* 2009 年 10 月 29 日 （木曜） [#b200e882]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 昨日，Snow Leopard 用 [[RMeCab]] のコンパイルをいろいろ試行したのだが，今日，ふっとみたらfinder のアプリケーションに R とは別に，R64 というアイコンを発見．64bitは別に用意されていたのだった．Mac 用 [[RMeCab]] を再作成．
- 午後
-- 裁量経費発表会，会議

* 2009 年 10 月 28 日 （水曜） [#d7d84f7d]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 08:35 - 10:10 演習
-- R-2.10.0 をとりあえずコンパイルし，[[RMeCab]] を作ってみる．
-- いつも思っていたのだが，Windows 版バイナリは XP と Vista のどっちでコンパイルすべきなのか．
- 午後
-- 12:50-16:05 授業
-- 64bit native snow で MeCab を 32 bit 対応でコンパイルせねばならない．
 CFLAGS="-arch i386" ARCHFLAGS="-arch i386" CCFLAGS="-arch i386"  
   CXXFLAGS="-arch i386"
     LDDLFLAGS="-arch i386 -bundle -undefined dynamic_lookup -L/usr/local/lib"
     LDFLAGS="-arch i386" ./configure

とかしていたが，[[ここ:http://www.sabaneko.jp/wp/?cat=17]]の情報を参考に試行してみる．
>
今日一日かかってなんとかSnow Leopardで自然言語処理の環境をそろえたので備忘録。
まず、Snow LeopardのXcodeで入るgccはgcc-4.20,g++-4.20です。こいつを使ってmakeすると、基本的にx86_64なバイナリができます。で、同時にVer 4.0も入っていて、これは32bit onlyです。そんでもって、gccやg++として、4.20が使われます。これはちょっと困るのですが、とにかく32bitのバイナリを作りたいので、ちょっと強引にシンボリックリンクの貼り直しをします。
    $ sudo rm /usr/bin/gcc
    $ sudo rm /usr/bin/g++
    $ sudo ln -s /usr/local/gcc-4.0 /usr/local/gcc
    $ sudo ln -s /usr/local/g++-4.0 /usr/local/g++ 
これで、MeCabなんかは普通にコンパイルすれば32bitで入ります。
次にText::MeCab、必要ないかもしれませんが、perl Makefile.PLで作ったMakefileを修正。以下がサンプル。（数字は行数）
6 CC = gcc
43 LD = gcc -mmacosx-version-min=10.6
44 LDDLFLAGS = -arch i386 -bundle -undefined dynamic_lookup -L/usr/local/lib
45 LDFLAGS = -arch i386 -L/usr/local/lib
要は、36、43行目のgcc-4.20をgccに、44、45行目に -arch x86_64があるのを消去です。これで後は普通にコンパイルすればOK。
あとはperlを32bitで動作させれば完璧ですが、archコマンド（初めて知った）を使えばいいみたいなので、以下のエイリアスを.bashrcにでも書いておけばいいでしょう。
alias perl=’arch -i386 /usr/bin/perl5.10.0′
<
//http://blog.chibiegg.net/2009/04/03_21_263.htm
//http://mlog.euqset.org/archives/debian-users/47640.html
//http://sites.google.com/site/casualconcj/yutiriti-puroguramu/mecab-ruby-wo-insutoru-suru

* 2009 年 10 月 27 日 （火曜） [#d7d84f7d]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- R-2.10.0 がリリースされたらしい．[[RMeCab]] をアップデートする必要があるが，週末にしておこう．
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
- 午後．総合科学部の生協に足のばしてパン類を買って済ます
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．

* 2009 年 10 月 26 日 （月曜） [#zf853530]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
- 午後，工学部．
// また勘定を間違えられる．


* 2009 年 10 月 25 日 （日曜） [#g7dc2d0a]

- 午前 tzdata アップデート
 Current default timezone: 'Asia/Tokyo'
 Local time is now:      Sun Oct 25 09:41:01 JST 2009.
 Universal Time is now:  Sun Oct 25 00:41:01 UTC 2009.
 Run 'dpkg-reconfigure tzdata' if you wish to change it.

* 2009 年 10 月 24 日 （土曜） [#v4f27cfb]
-- 05:30 起床
-- 07:00 研究室着
- 午前
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
- 午後
-- 閉じた式 (closed-form expression) の簡潔な説明がほしい．自分dねかくのは面倒と思っていたら，[[ここ:http://d.hatena.ne.jp/igaris/20090718/1247889699]] など非常によろしい．

* 2009 年 10 月 23 日 （金曜） [#hbee8cf3]
-- 05:30 起床
-- 07:00 研究室着
- 午前
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
- 午後
-- 心理学，国語学の先生方とテキストマイニング打ち合わせ


* 2009 年 10 月 22 日 （木曜） [#e11fcf78]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
- 午後．
-- 会議
-- 充電

* 2009 年 10 月 21 日 （水曜） [#f01d8712]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 08:35-10:00 演習．朝一の授業をうっかり忘れていて，10分遅れて出講．
-午後
-- 14:35-16:00 講義
-- Moodle サーバーの調整

* 2009 年 10 月 20 日 （火曜） [#g9ec8a82]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
--　大学の仕事でつぶれる
- 午後．外へ食事
// 600円豚ショウガ焼き
- 14:30-16:05 演習

* 2009 年 10 月 19 日 （月曜） [#n5035c07]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
--　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
-- D 大 J 先生から科研のご連絡
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．
-- 上記の初版では，ベータ分布の超母数を推定するのに，try and error (p.23)とあって，当時，読んでいて，「これで読者は納得するだろうか」と思ったものだが，今回訳出している第2版では，beta.select() という関数が実装されており，これを使って推定するという記述に変わっている．
--- beta.select()関数の出力がテキストと一致しない．丸めの問題なんだろうけど．
--- う～ん，テキスト掲載の数値に間違いが多い．これを恐れていた．
- 午後
-- 久保先生が訳出された &htmlinsert(amazontext,asin=4320019059,text=Rグラフィクス); を献本頂いた．ひもといてみると，訳文が「です，ます」調で，とても分かりやすい．

* 2009 年 10 月 18 日 （日曜） [#d9e3f459]
-- 特になし

* 2009 年 10 月 17 日 （土曜） [#qa1b64ce]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
--　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]の訳出を続ける．

* 2009 年 10 月 16 日 （金曜） [#od90a3d5]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
--　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
-- [[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]を続ける．
- 午後．来客と食事
// 600円 * 2
--[[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]] の原著者 Sarkar の発音だが，ショーカーが，母国語に一番近いらしい．

* 2009 年 10 月 15 日 （木曜） [#rf5be032]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- Xcode 再確認
--　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
- 午後
//参照弁当をseikyouで買う．380円なり
--　14:35-19:30　もろもろの会議

* 2009 年 10 月 14 日 （水曜） [#qcc8482e]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 朝一でプログラミング授業
--　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
- 午後。工学部にて
//スペシャル400円。鳥の梅紫蘇つつみフライ。キャベツ、ご飯、味噌汁
--　14:35-16:05　講義
-- 久しぶり Ubuntu で Lattice グラフを作成しようとしたら

 semi-transparency not supported on device 

のメッセージ．R-2.9.0 から Cairo 周りが強化されたためか．慌てて Cairo 関連のライブラリを追加．

* 2009 年 10 月 12 日 （火曜） [#y19c7f9f]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[PHPでのXMLパーサ>PHP_XML]]を設定
-午後。工学部にて
//ランチ350円。鳥のフリッターと炊き込みご飯、味噌汁だったか？

* 2009 年 10 月 12 日 （月曜） [#nb243c0a]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4254126980,text=ベイズ統計データ分析);  を引っ張り出して，眺めはじめる．これと&htmlinsert(amazontext,asin=4254295405,text=入門ベイズ統計学); は，分かりやすく書かれていると思うけど，そのための事例が前者はゴルフ，後者は金融工学，事例が特殊すぎて（少なくとも私はゴルフに興味はない），そこで興味を失う読者もいるのではないだろうか．もっとも，わかりやすさでは，&htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); が一番． 実用的という意味では， &htmlinsert(amazontext,asin=4254126972,text=マルコフ連鎖モンテカルロ法); が一番か．
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4254126980,text=ベイズ統計データ分析);  のデータをダウンロードしてみた．解凍したらフォルダ名やらファイル名が，全角日本語である．今時，文句を言って悪いのだが，個人的には半角アルファベットだと有り難かった．
--- 本文誤植，コードミス，記述ミスが異様に多いなぁ．．．
--- p.14-15. で一様分布に言及しているが，式や計算コードはまったく無いにもかかわらず，p.26 では「すでに計算過程をみたように」とある．原稿が欠けたのだろうか？
-- 疲れたので，やめた．そろそろ仕事にかかろう．
- 午後
//お菓子とカップめん
-- では[[Bayesian Computation with R:http://www.springer.com/statistics/statistical+theory+and+methods/book/978-0-387-92297-3]]にとりかかることにする．[[現著者サポートサイトはここ:http://bayes.bgsu.edu/bcwr/]]．
-- メインソース眺めたら

 \usepackage{Sweave}

とある．include されたファイルを眺めると，コード部分は確かに

 \begin{Schunk}
 \begin{Sinput}
   > ps = sample(p, replace = TRUE, prob = post)
 \end{Sinput}
 \end{Schunk}

となっている．
しかし，原稿TeXソース自体は [[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]] や [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] と比べるとシンプル．
-- 充電

* 2009 年 10 月 11 日 （日曜） [#ye4b6346]
- 特記無し

* 2009 年 10 月 10 日 （土曜） [#dded8ac0]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- あれこれたまっていた本を眺める

* 2009 年 10 月 9 日 （金曜） [#c9f000db]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- Mac Leopard で R をソースからインストールしてみた．
問題なくコンパイルでき，コマンドラインで使えるようになったのだが R CMD SHLIB の挙動がおかしい．
- 午後.来客と食事
-- ぼけていた。パッケージのコンパイルは
 R CMD build --binary packageName
であって
 R CMD SHLIB build --binary packageName
や
 R CMD -build --binary packageName
ではない．

* 2009 年 10 月 8 日 （木曜） [#w6d029bf]
-- 06:00 起床
--- 台風はたいしたことなかった
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直しを終える．
-午後
-- 情報処理の基礎II

* 2009 年 10 月 7 日 （水曜） [#h1e2ac49]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 朝一でプログラミング授業．
-- iPod Touch の音が鳴らなくなった．初期化する．
--- すると iTunes で iPodTouch の項目がすべてグレーになり，操作できない．iTunes 上で「手動で管理」を選ばないといけないらしい．
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
-午後
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
-- 17:00 歯医者
* 2009 年 10 月 6 日 （火曜） 雨 [#i6b9e95f]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
-午後．工学部脇のベルマン．いかにも学生飯．
// 540 円
-- 情報処理の基礎1
--　iPhone　関連
-- 台風が8日にも上陸というので、休講の条件を調べる。大学のサイトをいくら調べても分らんので、ググると、徳島大学休校規定が出てきた。
---警報発令時の対応

 暴風警報と大雨警報
 暴風警報と洪水警報
 大雪警報

---のいずれかが徳島県北部に発令されたとき，休講となります．

 午前７時の時点で発令午前中は休講 
 午前11時の時点でも発令中午後も休講
 授業開始後に発令されたとき，次の時限から休講

* 2009 年 10 月 5 日 （月曜） 曇 [#h73ea337]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
- 午後
-- 古い core3duo マシンに 64 bit Ubuntu 9.04 をインストールし，開発環境整備． で R と MeCab をいれて，[[RMeCab]] 64 bit 版を作成する．

* 2009 年 10 月 4 日 （日曜） 晴 [#r351ec55]
- 午後．大学に出向く
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
* 2009 年 10 月 3 日 （土曜） 晴 [#ae898916]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業
- 午後
-- 16:00 歯医者．待ち時間を含めて1時間半かかった．
-- 瀬戸内Linux 会をのぞく

* 2009 年 10 月 2 日 （金曜） 雨 [#re49f969]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
-- じめじめしてかなわん．
- 午前
-- DELL のデスクトップマシンが，起動しなくなった．電源を入れた直後の DELL メーカーロゴで止まり，F2 などを押しても，BIOS 設定画面にも移行してくれない．何度やっても甲斐なし．CMOS クリアで何とかなるだろうか？と思いつつ，とりあえず，いったんコンセントを抜いて，しばらく待った後，もう一度電源いれると起動した．
- 午後
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] の見直し作業．
-- S 社よりドイツ語の本が送られてきた．


* 2009 年 10 月 1 日 （木曜） 晴 [#v467c11b]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- [[R Through Excel:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-1-4419-0051-7]] を進める．
- 午後
-- 後期最初の授業．『情報処理の基礎』
アールメカブ

日録2009年10月 のバックアップの現在との差分(No.28)

日録2009年10月のバックアップの現在との差分(No.28)
