日録 の変更点 - RとLinuxと...

RとLinuxと...


日録 の変更点


[[過去の日録]]


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&htmlinsert(amazon,transitional,"asins=4431102205");

R関係サイト
-[[RpWiki:http://www.okada.jp.org/RWiki/]]
-[[統計分析環境 R のための検索エンジン:http://seekr.jp/]]
-[[Revolutions:http://blog.revolutionanalytics.com/]]
- [[R-bloggers:http://www.r-bloggers.com/]]
- &ref(http://www.inside-r.org/sites/all/themes/rweb/images/logo.png); [[Inside-R:http://www.inside-r.org/]]

/////////// for Youyube
// #htmlinsert(u2b,id=UZkaZhsOfT4,width=640,height=385,style=text-align:left;)
//#htmlinsert(u2b,id=,width=512,height=308,style=text-align:left;)

//#ref(R_Lattice/lattice113.png)
//&htmlinsert(amazontext,asin=4431100695,text=ショーカー著『R グラフィックス自由自在』シュプリンガー社); 
//[[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]]

//#htmlinsert(twitter,user=R_Linux,count=2)
// &htmlinsert(amazontext,asin=,text=); 

//#htmlinsert(amazonads)
// &htmlinsert(amazontext,asin=,text=); 
//#htmlinsert(u2b,id=,width=640,height=385,style=text-align:left;)
//#htmlinsert(u2b,id=,width=512,height=308,style=text-align:left;)

* 2011 年 05 月 31 日 (火)晴 [#dc7e081d]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室
- 午前
--報告書の作成を一つ忘れていた
- 午後
--16:20-18:00 演習

* 2011 年 05 月 30 日 (月)晴 [#r846e84a]
-- 06:00 起床
--09:00 研究室
- 午後
--14:40-16:05 演習


* 2011 年 05 月 29 日 (日)雨 [#ief06367]
-- 07:00 起床
- 神戸を出る

* 2011 年 05 月 28 日 (土)雨 [#h4e0359a]
-- 07:00 起床
- 神戸に出る

* 2011 年 05 月 27 日 (金)雨 [#n03bb5ff]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- 午前
-- 朝イチで確率論の講義
- 午後.来客と食事
-- [[RapacheをUbuntuで設定という記事:http://www.r-bloggers.com/notes-to-self-getting-rapache-working-in-natty-narwhal-ubuntulinux/]]があった

* 2011 年 05 月 26 日 (木)雨 [#a7b85599]
-- 06:00 起床
-- 07:30




* 2011 年 05 月 19 日 (水)晴 [#d3118cef]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- 午前
-- 最近同じ仕事の繰り返しなので,別に書くこともない
-- 


* 2011 年 05 月 18 日 (水)晴 [#g7100cbf]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- 午前
-- とりあえずスライドの雛形を作成した
- 午後
-- 14:30-16:00 講義


* 2011 年 05 月 17 日 (火)晴 [#u1cae852]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- 午後
-- 16:30-19:00 演習



* 2011 年 05 月 16 日 (月)晴 [#daca1a07]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- 午後
-- 14:30-16:00 演習



* 2011 年 05 月 15 日 (日)晴 [#ef3c62ec]
-- 06:00 起床
-- 07:30
- dvipdfmx がエラーを吐く

 ** ERROR ** Could not find encoding file "H".
とりあえず 
 export CMAPFONTS=/usr/share/ghostscript/9.01/Resource/CMap
を実行してしのぐ.リンク切れが原因なので,以下のように対処

 $ find /usr/local/texlive/p2009/texmf/fonts/cmap/ -type l  | xargs file
 /usr/local/texlive/p2009/texmf/fonts/cmap/ghostscript: broken... symbolic link to `/usr/share/ghostscript/9.01/Resource/CMap'
 $ sudo rm /usr/local/texlive/p2009/texmf/fonts/cmap/ghostscript 
 $ sudo ln -sf /usr/share/ghostscript/9.01/Resource/ /usr/local/texlive/p2009/texmf/fonts/cmap/
 $ sudo /usr/local/texlive/p2009/bin/i686-pc-linux-gnu/mktexlsr

* 2011 年 05 月 14 日 (土)晴 [#y43b78cf]
-- 06:00 起床
-- 07:30


* 2011 年 05 月 13 日 (金)晴 [#nfe2af2c]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午後.来客と食事
// アサリ弁当一つとお茶,せんべいで 700円弱


* 2011 年 05 月 12 日 (木)曇・雨 [#c38524f1]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午後
-- 13:00-14:30 演習
--14:30-16:00 会議

* 2011 年 05 月 11 日 (水)曇・雨 [#qf863033]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午後
-- 14:35-16:05 講義

* 2011 年 05 月 10 日 (火)曇・雨 [#je92a804]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午後
-- [[いつかEclipseからRを動かそうと思っているが未だに実行しておらず:http://lukemiller.org/index.php/2011/05/one-minor-detail-for-getting-64-bit-r-2-13-running-with-eclipsestatet/]]

* 2011 年 05 月 09 日 (月)晴 [#v4ad014e]
-- 06:00 起床
-- 07:30

* 2011 年 05 月 08 日 (日)晴 [#fb382899]
-- 07:00 起床

* 2011 年 05 月 07 日 (日)晴 [#v069740a]
-- 06:00 起床
-- 07:30



* 2011 年 05 月 06 日 (土)晴 [#t72d57b0]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午前
--[[カッコーの托卵データ:http://www.r-bloggers.com/cuckoo-eggs/]]
- 午後
-- [[RMeCab]] の PPC Mac 版をコンパイル

* 2011 年 05 月 05 日 (金)晴 [#v11f761d]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午前


* 2011 年 05 月 04 日 (木)晴 [#hdb2aa45]
-- 06:00 起床
-- 07:30
-午前
-- [[Running R on an iPhone/iPad with RStudio:http://www.r-bloggers.com/running-r-on-an-iphoneipad-with-rstudio/]]
-午後
-- [[RHIPE - R and Hadoop Integrated Processing Environment:http://www.stat.purdue.edu/~sguha/rhipe/]]
-[[Putting Robust Standard Errors into LaTeX Tables An Extension of mtable:http://www.r-bloggers.com/putting-robust-standard-errors-into-latex-tables-an-extension-of-mtable/]]

* 2011 年 05 月 03 日 (水)曇,夜一時雨 [#y3d93297]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室
- 午後
-- Rstudio サーバー版だが,R を Ubuntu レポジトリから r-base-dev など一式を入れたのだが,バージョンが古すぎて,[[inline:http://cran.r-project.org/web/packages/inline/index.html]] や [[Rcpp:http://cran.r-project.org/web/packages/Rcpp/index.html]] を動かせない.
とりあえず手作業で以下を導入し直した.鯖はなお 10.04 なので,後でアップデートなどで問題になるかもしれない
---[[GNU R package for Seamless R and C++ Integration:http://packages.ubuntu.com/natty/math/r-cran-rcpp]]
---[[GNU R package to inline C, C++, Fortran functions from R:http://packages.ubuntu.com/natty/gnu-r/r-cran-inline]]
// [Ubuntu R install] $ sudo apt-get install r-recommended 


* 2011 年 05 月 02 日 (火)曇 [#u27b42b0]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室
- 午後
--[[Another review of Introducing … R:http://xianblog.wordpress.com/2011/05/03/another-review-of-introducing-r/]]


* 2011 年 05 月 01 日 (月)晴 [#v961e514]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室
- 午後
-- R をコンパイルし直した
 $ sudo apt-get install libatlas-base-dev
 $ ./configure --with-blas="-lf77blas -latlas" --enable-R-static-lib
 ...
 checking for cblas_cdotu_sub in vecLib framework... no
 checking for dgemm_ in -lf77blas -latlas... yes
 checking whether double complex BLAS can be used... yes
 checking whether the BLAS is complete... yes
 ...
 R is now configured for x86_64-unknown-linux-gnu
 
  Source directory:          .
  Installation directory:    /usr/local
 
  C compiler:                gcc -std=gnu99  -g -O2
  Fortran 77 compiler:       gfortran  -g -O2
 
  C++ compiler:              g++  -g -O2
  Fortran 90/95 compiler:    gfortran -g -O2
  Obj-C compiler:	      
 
  Interfaces supported:      X11, tcltk
  External libraries:        readline, BLAS(ATLAS), ICU
  Additional capabilities:   PNG, JPEG, TIFF, NLS, cairo
  Options enabled:           static R library, R profiling, Java
 
  Recommended packages:      yes
--[[Building and checking R source packages for Windows:http://win-builder.r-project.org/]]



* 2011 年 05 月 01 日 (日)晴 [#c72741ef]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室