日録2009年10月

過去の日録

Lattice Multivariate Data Visualization with R

_ 2009 年 10 月 31 日（土曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 米国 Apple から、PushNotification? を利用可能にしたというメールが届く。2か月前に文句を送っていて、さんざんあれこれメールのやり取りをした挙句、ようやく。
午後
- 　さっそく　Notification　を実装したアプリを試作してみる。Pushを送るにはサーバーを用意するのだが、実験なので、とりあえずローカルマシンに簡単な PHP コードを用意して送信してみる。
  - 　なるほど、これは便利。
- 　歯医者。昨日詰めてもらったセメントが取れてしまった。

↑

_ 2009 年 10 月 30 日（金曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 雑用に追われる
午後
- 歯医者

↑

_ 2009 年 10 月 29 日（木曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 昨日，Snow Leopard 用 RMeCab のコンパイルをいろいろ試行したのだが，今日，ふっとみたらfinder のアプリケーションに R とは別に，R64 というアイコンを発見．64bitは別に用意されていたのだった．Mac 用 RMeCab を再作成．
午後
- 裁量経費発表会，会議

↑

_ 2009 年 10 月 28 日（水曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 08:35 - 10:10 演習
- R-2.10.0 をとりあえずコンパイルし，RMeCab を作ってみる．
- いつも思っていたのだが，Windows 版バイナリは XP と Vista のどっちでコンパイルすべきなのか．

午後

12:50-16:05 授業

64bit native snow で MeCab? を 32 bit 対応でコンパイルせねばならない．

CFLAGS="-arch i386" ARCHFLAGS="-arch i386" CCFLAGS="-arch i386"  
  CXXFLAGS="-arch i386"
    LDDLFLAGS="-arch i386 -bundle -undefined dynamic_lookup -L/usr/local/lib"
    LDFLAGS="-arch i386" ./configure

とかしていたが，ここの情報を参考に試行してみる．

今日一日かかってなんとかSnow Leopardで自然言語処理の環境をそろえたので備忘録。まず、Snow LeopardのXcodeで入るgccはgcc-4.20,g++-4.20です。こいつを使ってmakeすると、基本的にx86_64なバイナリができます。で、同時にVer 4.0も入っていて、これは32bit onlyです。そんでもって、gccやg++として、4.20が使われます。これはちょっと困るのですが、とにかく32bitのバイナリを作りたいので、ちょっと強引にシンボリックリンクの貼り直しをします。
   $ sudo rm /usr/bin/gcc
   $ sudo rm /usr/bin/g++
   $ sudo ln -s /usr/local/gcc-4.0 /usr/local/gcc
   $ sudo ln -s /usr/local/g++-4.0 /usr/local/g++ 
これで、MeCab?なんかは普通にコンパイルすれば32bitで入ります。次にText::MeCab?、必要ないかもしれませんが、perl Makefile.PLで作ったMakefileを修正。以下がサンプル。（数字は行数） 6 CC = gcc 43 LD = gcc -mmacosx-version-min=10.6 44 LDDLFLAGS = -arch i386 -bundle -undefined dynamic_lookup -L/usr/local/lib 45 LDFLAGS = -arch i386 -L/usr/local/lib 要は、36、43行目のgcc-4.20をgccに、44、45行目に -arch x86_64があるのを消去です。これで後は普通にコンパイルすればOK。あとはperlを32bitで動作させれば完璧ですが、archコマンド（初めて知った）を使えばいいみたいなので、以下のエイリアスを.bashrcにでも書いておけばいいでしょう。 alias perl=’arch -i386 /usr/bin/perl5.10.0′

↑

_ 2009 年 10 月 27 日（火曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R-2.10.0 がリリースされたらしい．RMeCab をアップデートする必要があるが，週末にしておこう．
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
午後．総合科学部の生協に足のばしてパン類を買って済ます
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．

↑

_ 2009 年 10 月 26 日（月曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
午後，工学部．

↑

_ 2009 年 10 月 25 日（日曜）

午前 tzdata アップデート

Current default timezone: 'Asia/Tokyo'
Local time is now:      Sun Oct 25 09:41:01 JST 2009.
Universal Time is now:  Sun Oct 25 00:41:01 UTC 2009.
Run 'dpkg-reconfigure tzdata' if you wish to change it.

↑

_ 2009 年 10 月 24 日（土曜）

05:30 起床
07:00 研究室着

午前
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
午後
- 閉じた式 (closed-form expression) の簡潔な説明がほしい．自分dねかくのは面倒と思っていたら，ここなど非常によろしい．

↑

_ 2009 年 10 月 23 日（金曜）

05:30 起床
07:00 研究室着

午前
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
午後
- 心理学，国語学の先生方とテキストマイニング打ち合わせ

↑

_ 2009 年 10 月 22 日（木曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
午後．
- 会議
- 充電

↑

_ 2009 年 10 月 21 日（水曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 08:35-10:00 演習．朝一の授業をうっかり忘れていて，10分遅れて出講．
午後
- 14:35-16:00 講義
- Moodle サーバーの調整

↑

_ 2009 年 10 月 20 日（火曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 　大学の仕事でつぶれる
午後．外へ食事
14:30-16:05 演習

↑

_ 2009 年 10 月 19 日（月曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
- D 大 J 先生から科研のご連絡
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．
- 上記の初版では，ベータ分布の超母数を推定するのに，try and error (p.23)とあって，当時，読んでいて，「これで読者は納得するだろうか」と思ったものだが，今回訳出している第2版では，beta.select() という関数が実装されており，これを使って推定するという記述に変わっている．
  - beta.select()関数の出力がテキストと一致しない．丸めの問題なんだろうけど．
  - う～ん，テキスト掲載の数値に間違いが多い．これを恐れていた．
午後
- 久保先生が訳出されたを献本頂いた．ひもといてみると，訳文が「です，ます」調で，とても分かりやすい．

↑

_ 2009 年 10 月 18 日（日曜）

特になし

↑

_ 2009 年 10 月 17 日（土曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
- Bayesian Computation with Rの訳出を続ける．

↑

_ 2009 年 10 月 16 日（金曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
- Bayesian Computation with Rを続ける．
午後．来客と食事
- Lattice Multivariate Data Visualization with R の原著者 Sarkar の発音だが，ショーカーが，母国語に一番近いらしい．

↑

_ 2009 年 10 月 15 日（木曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- Xcode 再確認
- 　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
午後
- 　14:35-19:30　もろもろの会議

↑

_ 2009 年 10 月 14 日（水曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 朝一でプログラミング授業
- 　S社から送られてきたドイツ語IT本を読む
午後。工学部にて
- 　14:35-16:05　講義
- 久しぶり Ubuntu で Lattice グラフを作成しようとしたら

semi-transparency not supported on device

のメッセージ．R-2.9.0 から Cairo 周りが強化されたためか．慌てて Cairo 関連のライブラリを追加．

↑

_ 2009 年 10 月 12 日（火曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- PHPでのXMLパーサを設定
午後。工学部にて

↑

_ 2009 年 10 月 12 日（月曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- を引っ張り出して，眺めはじめる．これとは，分かりやすく書かれていると思うけど，そのための事例が前者はゴルフ，後者は金融工学，事例が特殊すぎて（少なくとも私はゴルフに興味はない），そこで興味を失う読者もいるのではないだろうか．もっとも，わかりやすさでは，が一番．実用的という意味では，が一番か．
- のデータをダウンロードしてみた．解凍したらフォルダ名やらファイル名が，全角日本語である．今時，文句を言って悪いのだが，個人的には半角アルファベットだと有り難かった．
  - 本文誤植，コードミス，記述ミスが異様に多いなぁ．．．
  - p.14-15. で一様分布に言及しているが，式や計算コードはまったく無いにもかかわらず，p.26 では「すでに計算過程をみたように」とある．原稿が欠けたのだろうか？
- 疲れたので，やめた．そろそろ仕事にかかろう．
午後
- ではBayesian Computation with Rにとりかかることにする．現著者サポートサイトはここ．
- メインソース眺めたら

\usepackage{Sweave}

とある．include されたファイルを眺めると，コード部分は確かに

\begin{Schunk}
\begin{Sinput}
  > ps = sample(p, replace = TRUE, prob = post)
\end{Sinput}
\end{Schunk}

となっている．しかし，原稿TeXソース自体は Lattice Multivariate Data Visualization with R や R Through Excel と比べるとシンプル．

充電

↑

_ 2009 年 10 月 11 日（日曜）

特記無し

↑

_ 2009 年 10 月 10 日（土曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- あれこれたまっていた本を眺める

↑

_ 2009 年 10 月 9 日（金曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- Mac Leopard で R をソースからインストールしてみた．問題なくコンパイルでき，コマンドラインで使えるようになったのだが R CMD SHLIB の挙動がおかしい．
午後.来客と食事
- ぼけていた。パッケージのコンパイルは
```
R CMD build --binary packageName
```
  であって
```
R CMD SHLIB build --binary packageName
```
  や
```
R CMD -build --binary packageName
```
  ではない．

↑

_ 2009 年 10 月 8 日（木曜）

06:00 起床
- 台風はたいしたことなかった
07:30 研究室着

午前
- R Through Excel の見直しを終える．
午後
- 情報処理の基礎II

↑

_ 2009 年 10 月 7 日（水曜）

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- 朝一でプログラミング授業．
- iPod Touch の音が鳴らなくなった．初期化する．
  - すると iTunes で iPodTouch? の項目がすべてグレーになり，操作できない．iTunes 上で「手動で管理」を選ばないといけないらしい．
- R Through Excel の見直し作業
午後
- R Through Excel の見直し作業
- 17:00 歯医者

↑

_ 2009 年 10 月 6 日（火曜）雨

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R Through Excel の見直し作業
午後．工学部脇のベルマン．いかにも学生飯．
- 情報処理の基礎1
- 　iPhone　関連
- 台風が8日にも上陸というので、休講の条件を調べる。大学のサイトをいくら調べても分らんので、ググると、徳島大学休校規定が出てきた。
  - 警報発令時の対応

暴風警報と大雨警報
暴風警報と洪水警報
大雪警報

のいずれかが徳島県北部に発令されたとき，休講となります．

午前７時の時点で発令午前中は休講 
午前11時の時点でも発令中午後も休講
授業開始後に発令されたとき，次の時限から休講

↑

_ 2009 年 10 月 5 日（月曜）曇

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R Through Excel の見直し作業
午後
- 古い core3duo マシンに 64 bit Ubuntu 9.04 をインストールし，開発環境整備．で R と MeCab? をいれて，RMeCab 64 bit 版を作成する．

↑

_ 2009 年 10 月 4 日（日曜）晴

午後．大学に出向く
- R Through Excel の見直し作業

↑

_ 2009 年 10 月 3 日（土曜）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R Through Excel の見直し作業
午後
- 16:00 歯医者．待ち時間を含めて1時間半かかった．
- 瀬戸内Linux 会をのぞく

↑

_ 2009 年 10 月 2 日（金曜）雨

06:00 起床
07:30 研究室着
じめじめしてかなわん．

午前
- DELL のデスクトップマシンが，起動しなくなった．電源を入れた直後の DELL メーカーロゴで止まり，F2 などを押しても，BIOS 設定画面にも移行してくれない．何度やっても甲斐なし．CMOS クリアで何とかなるだろうか？と思いつつ，とりあえず，いったんコンセントを抜いて，しばらく待った後，もう一度電源いれると起動した．
午後
- R Through Excel の見直し作業．
- S 社よりドイツ語の本が送られてきた．

↑

_ 2009 年 10 月 1 日（木曜）晴

06:00 起床
07:30 研究室着

午前
- R Through Excel を進める．
午後
- 後期最初の授業．『情報処理の基礎』

Link: RMeCab(591d) 過去の日録(4886d) PHP_XML(5451d)

Last-modified: 2009-11-01 (日) 08:34:11 (5432d)

アールメカブ

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_ 2009 年 10 月 3 日 （土曜） 晴

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_ 2009 年 10 月 1 日 （木曜） 晴

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