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[[過去の日録]] //#htmlinsert(amazonads) // &htmlinsert(amazontext,asin=,text=); [[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]] //http://d.hatena.ne.jp/hdtooo/20081208/1228754676 //http://www.aoamedia.com/download.htm //http://blog.makotokw.com/portfolio/mtplugin/syntaxhighlighter/ #ref(R_Lattice/lattice113.png) * 2009年 6月 27 日 (土) 曇 [#yd6ae661] -- 07:00 起床 -- 08:15 研究室 - 午前 -- R-2.9.1 がreleaseされたそうだが，筑波CRANにはまだソースが登録されていなかった．なので本家から取得． http://cran.r-project.org/src/base/R-2/R-2.9.1.tar.gz -- とりあえず [[RMeCab]] の動作確認はできた． * 2009年 6月 26 日 (金) 曇 [#w87a92ab] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- libssl0.9.8 openssl アップデート - 午前 -- 「文系のための数学」 - 午後．来客と食事 -- iPhone/iPod で View を回転させる際，View 上のコントロールを個別に処理する方法を検討． * 2009年 6月 25 日 (木) 晴 [#x2ba4308] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- libsasl2-2 アップデート - 午前 -- 区間推定の説明をする必要があるのだが，数式をMoodleにださにゃならん．しばらく使っていなかったがmimetex は利用可能か？ #mimetex(z = \frac{\bar{x} - \mu}{\sigma / \sqrt{n}}) //#mimetex(\bar{x} -1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}} < \mu < \bar{x} + 1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}} ) &mimetex(\bar{x} -1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}}); < &mimetex( \mu); < &mimetex( \bar{x} + 1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}} ); - 午後 - 午後.久しぶり工学部食堂で栄養定食．例によって非常にまずいが，近いし，手っ取り早い．かやくご飯と鳥フリッター，肉じゃが（肉は見あたらないが），味噌汁． -- iPhone/iPod ワーク * 2009年 6月 24 日 (水) 曇 [#e1f8afee] -- 06:00 起床 -- 07:25 研究室 -- gstremaer0.10アップデート - 午前 -- iPhone/iPod の P2P接続とデータ交換の方法をおおむね把握した． - 午後 -- 14:35-16:00 講義 * 2009年 6月 23 日 (火) 晴 [#sf4bd698] -- 06:00 起床 -- 07:25 研究室 -- gstremaer0.10アップデート - 午前 -- iPhone/iPod の P2P接続とデータ交換を調べる - 午後 -- 14:35-18:00 演習 * 2009年 6月 22 日 (月) 曇 [#r475b1b4] -- 06:00 起床 -- 07:25 研究室 - 午前 -- iPod Touch および iPhone SDK を3.0にアップ． - 午後．蓬莱 -- Bluetooth 接続の実験 * 2009年 6月 21 日 (日) 曇 [#a693e8dd] -- 充電 * 2009年 6月 20 日 (土) 曇 [#t7007004] -- 06:15 起床 -- 07:55 研究室 -- file, libmagic, tzdata, tzdata-java アップデート - 午前 -- iPhone/iPod - 午後 -- iPhone/iPod * 2009年 6月 19 日 (金) 晴 [#pce9a9bd] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- app-install-data-commercial アップデート．なんだこりゃ？ - 午前 -- 演習「文系のための数学」． * 2009年 6月 18 日 (木) 晴 [#p747cdbf] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 - 午前 -- Mac にはデフォルトで SQLite が入っている．なのでWordNet 日本語版をiPhoneで使えるか試してみる． * 2009年 6月 17 日 (水) 晴 [#qbe4704f] -- 06:00 起床 -- 07:25 研究室 - 午前 -- Mac Leopard にデフォルトで入っている mecab は辞書が UTF-16になっていることに気が付いた． -午後．蓬莱 //http://yanchde.gozaru.jp/mingw/wingw_start.html * 2009年 6月 16 日 (火) 晴 [#qbe4704f] -- 07:25 起床 -- 09:00 研究室 - 午前 -- 科研執行のための書類が一つたまっていた． -午後．蓬莱 * 2009年 6月 15 日 (月) 曇 [#oc3e6be9] -- 06:25 起床 -- 暑いので，疲れが取れない． - 午後 - 統計数理研究所で簡単な報告をする． -- いろいろな分野の人から意見を聞くことができ，非常に参考になる． - 夕方の飛行機で帰宅 * 2009年 6月 14 日 (日) 曇 [#ie5daf25] -- 06:25 起床 - 統計数理研究所へ出張 * 2009年 6月 13 日 (土) 曇 [#e3f652a3] -- 06:25 起床 -- 07:45 研究室 --firefox, xulrunner update - 午前 -- [[RCaBoCha]]_0.20の調整．Ubuntu にインストールした VMware 上の WindowsXP で実験すると，おおむね大丈夫そうである．ただファイルを指定する際，フォルダ名を含めたパスを指定すると，その瞬間に R が落ちることがある．フォルダ名指定を外すと問題ない．妙だな．フォルダ名取得に問題があるのだろうか？ Linux では全然問題ないのだが． そこで Windowsパソコン３台を引っ張り出し，WindowsXP，Vista それぞれで試すが，正常に動作し，何の問題はない．どうやら Ubuntu 上のバーチャルマシンでの問題らしい．利用できるメモリに問題だろうか．しかし，試用した３台のWindowsパソコンのうち，一つはスペックの貧弱なミニノートだったが，データ大きくなるとさすがに解析に時間がかかったが，それでも落ちはしない．どうも Vmware上のファイルシステムの問題のような気もする． - 午後 -- Mac OS X 版[[RCaBoCha]] _0.20の準備．Boost をソースから入れる． とりあえず boost_1_33_1 を入れておく boost-jam-3.1.13 もダウンロードし，解凍後，ディレクトリを移り $ ./build.sh を実行すると MacOX86用の bjam がコンパイルされるので，これを boost_1_33_1を解凍したディレクトリにコピーし， $ ./bjam -sTOOLS=darwin stage を実行する．Python のパスは PYTHON_ROOT が /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.4 PYTHON_LIB_PATH が currently PYTHON_INCLUDE_PATH が /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.4/include/python2.4 と自動的にセットされた．Python を使うことはないのだが，バージョンは適切なのだろうか？ $ ./bjam -sTOOLS=darwin install $ sudo cp -r boost_1_31_1/boost /usr/local/include -- Mac で [[RCaBoCha]]_0.20 をコンパイルし，使ってみる．問題なさそうだ． * 2009年 6月 12 日 (金) 曇 [#ld8b91e5] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 - 午前 -- 文系のための数学．今日も担当ではないが，一応，教室には出向く．が，内職．Boost_library を利用した CPP ソースを Windows 上でコンパイルすることを試みる．特に問題なし． - 午後 -- R 用のCPP ファイルにBoost を含めるのだが，Linux や Mac ではコンパイルできるが，mingw on Windows では mingw32/4.2.1-sjlj/include/c++/3.3/bits/codecvt.h:110:52: macro "length" passed 4 arguments, but takes just 1 のエラー．これまで cpp の stream 系は用心深く避けてきた．[[ここで紹介されているような典型的なエラー:https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2005-January/065113.html]]があるからである．しかし，今回のはエラーはつぶすのがやっかいそうだ． --- やっかいそうだなと思ったのだが， #include<boost/tokenizer.hpp> の位置を，R 関連のヘッダよりも上に移動したら，あっさりコンパイラが通った．改めてググってみると，[[同様の回答:http://www.nabble.com/Re:-Accessing-C%2B%2B-code-from-R-p9843165.html]]があった． * 2009年 6月 11 日 (木) 曇 [#ld8b91e5] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- libaprutil1 update - 午前 -- &htmlinsert(amazontext,asin=4627848412,text=『Rによるテキストマイニング入門』森北出版); 重版の連絡． - 午後．工学部 // 栄養420円．タルタルフリッター，目玉焼き，キャベツ，味噌汁，玉葱と人参のかき揚げ丼． -- vmware-config.pl 再実行．Kernel のバージョンアップ後，一度も実行していなかったらしい． * 2009年 6月 10 日 (水) 曇 [#mafd9cd2] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- libmagick10 update - 午前 -- よそ様のサーバーの設定を調整してあげる．ごちゃごちゃしていたり，抜けていたりと，思ったよりも手間取った． - 午後 -- 14:35-16:00 講義 -- Firefox に欧米語インライン機能をつける。about:config で layout.spellcheckDefault を2に設定.これで1行テキストフィールドでも使えるようになる。ただし辞書を追加する必要がある。Googleの検索入力欄あたりで右クリックし、メニューの辞書の追加をクリックして、適当にインストールする。 * 2009年 6月 9 日 (月) 曇 [#nc544f25] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 - 午前 -- 大学院授業資料の準備 - 午後 -- 14:35-17:00 演習 //http://debz-di.kabocha.to/archives/2006/08/20060822023922.html * 2009年 6月 8 日 (月) 曇 [#d7d327a2] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 - 午前 --[[RCaBoCha]] を大幅に修正した．来週後半以降，公開する． - 午後 -- [[boost/tokenizer.hpp>Boost_tokenizer]] のプログラムチェック．使えそう． //Apache2でmod_limitipconnを使う方法 // http://www.thinkit.co.jp/cert/article/0706/3/8/3.htm //http://www.momo-i.org/?Apache%E3%81%AE%E3%83%A2%E3%82%B8%E3%83%A5%E3%83%BC%E3%83%AB%E3%82%92%E8%A9%A6%E3%81%99 //http://wp.serpere.info/archives/tag/apache * 2009年 6月 7 日 (日) 晴 [#qceea39c] -- 充電 * 2009年 6月 6 日 (土) 曇 [#i64dfcad] -- 06:45 起床 -- 08:15 研究室 -- pm-utils update - 午前 - [[RCaBoCha]] 実装 * 2009年 6月 5 日 (金) 曇 [#qb7a9f4c] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 - 午前 -- 08:35-10:10 まで「文系のための数学」担当 -- Mac 版 ESS で R を起動したらローケルが C になっている． emacs.elに以下を追記したら，日本語で起動できた．しばらく Mac でESS を使っていなかったのだが，以前は，以下2行はなくとも日本語モードで起動したような気がするのだが． (set-locale-environment "utf-8") (setenv "LANG" "ja_JP.UTF-8") ついでに ESS 上では options(device = "quartz") と指定する． -午後．来客と食事 * 2009年 6月 4日 (木) 曇 [#k0d1804b] -- 05:45 起床 -- 07:15 研究室 -- cups, purple, pidgin アップデート有り - 午前 --[[RMeCab]] のメモリ回りを調整 * 2009年 6月 3日 (水) 雨 [#acfa0b6a] -- 06:00 起床 -- 07:30 研究室 - 午前 --synaptic で libboost-dev libboost-dbg をインストール． -- CaBocha のインターフェイスを使ったコードでmbstowcsを使っているのだが，文字列が長くなると buffer overflow detected となるローケルを C にセットすればいいのだが，そうすると，それ以降の実装で問題が生じる．う〜ん，実装を見直すか．．． - 午後 -- 14:35-16:05 講義 -- CaBoCha インターフェイスのbuffer overflow 問題解決．つまらないところを見落としていた． * 2009年 6月 2日 (火) 晴 [#la52579e] -- 06:00 起床 -- 07:30 研究室 -- cron update - 午前 -- 金先生の著作のコードを使って igraph_0.5.2-2 のネットワークを描こうとすると，次のエラーに遭遇した． [tcl] bad screen distance "R_call 0xa4bd9d4 2.122e-314raph". tcl/tkは8.5なのだが，サンプルコードなどは動くので，どうやらこのバージョンの igraph ではコードに修正が必要なようだ．金先生のコードに関しては，単に vertex.size=1 を省けば描画された． - 午後 --14:35-16:05 演習 -- [[RCaBoCha]] の開発に入る． * 2009年 6月 1日 (月) 晴 [#m5e29284] -- 06:00 起床 -- 07:30 研究室 - 午前 -- 久しぶりに「論文」にシフト - 午後．蓬莱小．若い人が調理してくれたが，いまいち． -- igraph パッケージを使おうと思ったら，Tcl.Tk が無いと言われる． Synaptic からインストールして，R をコンパイルし直す．Tck Tk をサポートした R バイナリだと，install.pacakgesを実行するたびに，レポジトリを指定するウィジェットが起動する．.Rprofile に以下を追記． options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp") -- emacs.ubuntu.8.10.Atok.el の設定を変更