日録2009年8月 のバックアップ(No.31) - アールメカブ

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日録2009年8月 のバックアップ(No.31)

過去の日録

lattice113.png

Lattice Multivariate Data Visualization with R

_ 2009 年 8 月 21 日（金）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
  • 午後．第二食堂ランチ．レンコンメンチカツ？
↑

_ 2009 年 8 月 20 日（木）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • を続ける．サンプルの解析は JAGS + rjags で実行しているが，データは WinBUGS の形式で与えられているので，データを取り出すためだけに Wine を起動するのが，面倒．
    • 上記の本は，コード部分の解説がまるで訳されていない．やっぱり訳すべきだろう．ところが，翻訳掲載のコードコメントの内容が変である．原著者サイトからダウンロードしたコードと照らし合わせてみると，後者の方では修正されている．翻訳に掲載されたコードと，そのコメントは信用しない方がよさそう．
  • 午後．第2食堂スペシャル．チキン
↑

_ 2009 年 8 月 19 日（水）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 朝いちでネットワーク不通
    • を読む．
  • 午後
    • 暑いさなか，電気量販店にヘッドフォンを行く．
  • 帰ってから を続ける．
↑

_ 2009 年 8 月 18 日（火）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • WinBUGS では2変量正規の分布のデータを与える場合，data に対して，単純にリストを二つ与えればいいようだが，JAGSでの与え方がよく分からない．それぞれ別々に与えて分析する手もあるが，同時に実行したい．
    • WinBUGS にあるスカラー値を返す rank(), ranked() も JAGS では挙動が違う．WinBUGS 1.4 マニュアルによれば
rank(v, s)  # number of components of v less than or equal to v_s
ranked (v, s)  # the s_th smallest component of v
  • 午後
    • 15:00から16:30までテキストマイニングに関する会議
↑

_ 2009 年 8 月 17 日（月）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • s社に書類送付．
  • 午後．第２食堂．鳥のフリッター？
    • rjags のモデルで初期値に0.5を与えたら
d = c(0.5, 0.5)

エラーが出た．

Current value is inconsistent with data

モデル的には問題ないはずなのになぁ，と思って，何気なく以下のように変更したら通った．

d = c(.5, .5)
↑

_ 2009 年 8 月 16 日（日）晴

  • 特に変わったことなし
    • 充電
↑

_ 2009 年 8 月 15 日（土）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
↑

_ 2009 年 8 月 14 日（金）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 引き続き を読む．
  • 午後
    • R 2.9.2 Scheduled for August 24, 2009　という通知が来た．またバージョンアップか．
    • Bayesian Computation with R を改めて眺める．読むだけでは感触がつかめないので，少し訳したりしている．
    • R Through Excel も出たようだ．これは，さくっとできそう．
↑

_ 2009 年 8 月 13 日（木）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 研究室の整理もおおむね終わったので，昨日の片付けをして，ラボに向かう．
    • Dynamic Objective-Cのメソッドパッシングというのがよく分からないので，Dynamic Objective-C を読む．メソッドパッシングという言葉自体は出てこないのだが，｢メソッドとは何か｣以降に詳しく書いてあって，非常にわかりやすい．
  • 午後．近くのスーパーで弁当．
    • を読む．これは和書の中では，初心者にも非常に取っつきやすい本だろう．ただ Ubuntu/Mac 上で rjags を使っているものからすると，サイトのデータは使いにくい．WinBUGS のデータ形式なのである．それに，掲載コードに少し間違いがある．
    • さらに rjags 独特の面倒もある．WinBUGS なら，以下のように書けるが，rjags では Y　が再定義されたと怒られる． 
      Y [i] <- log( C3 [i] + 1)
Y [i] ~ dnorm (mean [i] , prec)
      なので，これを回避すべく，たとえばモデル定義で
data = list( LONG = dat$LONG, LAT = dat$LAT, C3 = dat$C3, 
             Y = log(dat$C3 + 1 )),

などとしなければならない． そのほか，任意のxに対する予測値yをシミュレートするにも，若干コードを書き直す必要がある．

↑

_ 2009 年 8 月 12 日（水）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 研究室の片付けを今日中に終えるべく，途中，水を飲むだけで，夕方17時までぶっ通しで作業する．
  • 午後
    • 17:00 作業終了．いくつかの書類を整理しなければならないが，まあ，95%　作業が完了した．
    • 阿波踊りが始まったので，18時過ぎると街が混み合ってくる．その前に自宅に帰る．
↑

_ 2009 年 8 月 11 日（火）快晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • いよいよ引っ越しも佳境に入ってきた
    • サーバーを旧研究室に仮移転
  • 午後．工学部食堂．スペシャル．カツの卵とじ？
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_ 2009 年 8 月 10 日（月）大雨

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 総合科学部と工学部を挟む道路が水没してしまっており，ラボへ渡ることができない．
    • 仕方ないので，移転の準備をする．
  • 午後．工学部食堂でスペシャル．味噌カツ．さすがに誰もいない．
↑

_ 2009 年 8 月 9 日（日）大雨

  • 　大雨で，かつ蒸し暑い．
↑

_ 2009 年 8 月 8 日（土）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • オープンキャンパス準備
  • 午後
    • 　オープンキャンパス
    • Apple社の担当者を交えて慰労会．
↑

_ 2009 年 8 月 7 日（金）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 　「文系数学」最後の授業
  • 午後．来客と食事
    • iPhone関連企画
    • 明日のオープンキャンパス準備
↑

_ 2009 年 8 月 6 日（木）雨

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 移転に向けた作業を少しずつ行う
    • 出版社が送ってきてくれた原書に目を通す．
  • 午後
    • オープンキャンパス準備
↑

_ 2009 年 8 月 5 日（水）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 移転に向けた作業を少しずつ行う
    • 　iPhone関連の作業を同僚と続ける．別の同僚がサーバーやWebの管理をしてくれるはずだったのだが，実はサーバー等の知識がないことが判明し，結局，私がやった．
  • 午後
    • 出版社から相談のメール．
    • 　充電
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_ 2009 年 8 月 4 日（火）晴

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 朝から，インストールしたばかりの Ubuntu 9.04の設定。開発環境を入れ，TeX を入れ，R　を入れ，MeCab? を入れ，VMpalyer を入れ，次に VMPlayer 上に XP, 同じく開発環境を整備する．
  • 午後
↑

_ 2009 年 8 月 3 日（月）曇・雨

  • 06:00 起床
  • 07:30 研究室着
  • 午前
    • 出版社と新しい本についてやりとり．
    • Ubuntu 9.04 をインストールしようとしたら，CD　が壊れていた．．
  • 午後．Apple社の方と面談の予定．その前にK氏と食事に出る．
    • Ubuntu + USB無線Lan子機 + WPA2-PSK(AES)認証がうまくいかない。USB 機器は認識しており、周囲の無線も拾っているので、認証の問題だと思うのだが、GUI無線Manager　や wpa_supplicant.config など、あれこれ試すも、接続に至らない。
  • etc/network/interfaces
auto lo
iface lo inet loopback

auto rausb0
iface rausb0 inet dhcp
wpa-driver wext
wpa-conf /etc/wpa_supplicant/wpa_supplicant.conf
  • wpa_supplicant.conf
ctrl_interface=/var/run/wpa_supplicant
ap_scan=2
network={
	ssid="hogehoge"
	#psk="hogehoge"
       psk=123456789...abcdef1234
	key_mgmt=WPA-PSK
	proto=RSN
	pairwise=CCMP
	group=CCMP
}
  • WEP接続にしてしまえという誘惑に駆られる。
  • それにしても暗号化の種類、多すぎる。ここに手短にまとまっていた。
↑

_ 2009 年 8 月 2 日（日）晴

  • 自宅
↑

_ 2009 年 8 月 1 日（土）曇・雨

  • 05:30 起床
  • 07:00 研究室着
  • 午前
    • 大学の雑用を片付ける
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