アールメカブ

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[[過去の日録]]


//#htmlinsert(amazonads)
// &htmlinsert(amazontext,asin=,text=); 

#ref(R_Lattice/lattice113.png)
[[Lattice Multivariate Data Visualization with R:http://www.springer.com/statistics/computational/book/978-0-387-75968-5]]

//http://hisside.gozaru.jp/ubuntu-wli-u2-kg54.htm
//https://forums.ubuntulinux.jp/viewtopic.php?id=877
//http://www.macupdate.com/info.php/id/19769/isquint
//
* 2009 年 8 月 29 日（土）晴 [#rcc083e4]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 先週末にS社より契約書2通が届いている。
--HDを発注。何でもいいから至急納品してくれと・
-午後
--大学の雑用が怒涛のように押し寄せる。

* 2009 年 8 月 30 日（日）晴 [#j30fd23f]
-自宅

* 2009 年 8 月 29 日（土）晴 [#rcc083e4]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- ServerのHDの寿命が近いもよう．
-- 念のためバックアップをしつこく取るが、HDの
方は、もはやよたよた。
-午後
-- 研究室移転まで約2週間近く、エアコンもない暑い部屋においていたせいだろうか。
--やまだ電気に行くと、内蔵HDは品数も少なく、しかもUltraATAばかりだ。
--結局、一日何もできず、サーバーをとめて帰宅。

* 2009 年 8 月 28 日（金）晴 [#k6f72e39]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- Vista からデフォルトで入っていた Norton を抜こうとするが，LiveUpdate なるものだけが，[プログラムの削除]を使ってアンインストールできない（ようにみえる）．仕方なくレジストリをいぢる．Windows系のPCメーカーは，こんなものをデフォルトでインストールして売るな．

* 2009 年 8 月 27 日（木）曇 [#s02c83b5]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 久しぶり原稿を書き始めたのだが \noindent を補完するショートカットを忘れてしまった．
-- [[RExcel]] の準備にかかる。10月末には終えて，次の Bayes に移りたい。
- 午後．第2食堂ランチ．
-- Vista ってのは，つくづく腹の立つOSだ．こんなものを日常使っている人の気がしれん．

* 2009 年 8 月 26 日（水）晴 [#z115ed70]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- S社から新規の二冊について連絡あり．
- 午後．コンビニ．
-- 久しぶりでドイツ語の本を読む．Methode der kleinsten Fehlerquadrate と出てきた．前後関係から最小自乗法のことらしい．
-- 充電

* 2009 年 8 月 25 日（火）晴 [#z115ed70]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- R-2.9.2がリリースされたので、[[RMeCab]], [[R2MeCab]] をアップデート。ついでに，docNgram2() 関数と docNgramDF() 関数に残っていたバグを修正しておく．
-- [[RCaBoCha]]作成のため boost_1_35 をUbuntuに入れる。
-- さらに Windows XP (on Ubuntu 9.04) に Boost-1_33_1 を入れて，jam を使ってコンパイルを始めるが，これがなかなか終わらん．
- 午後
-- iMac にも Boost をインストール．こっちは，正しい？手順がわからんので，上記 XP でのコンパイル方法を踏襲する． 
-- [[boostをインストール>Boost_Install]]したので，[[RCaBoCha]] もヴァージョンアップする．こちらは機能の追加や修正は行っていない．
-- 舟尾 暢男 先生(著) &htmlinsert(amazontext,asin=4877832297,text=R流!イメージで理解する統計処理入門); を献本頂いた．どうもありがとうございます．

* 2009 年 8 月 24 日（月）晴 [#e724ed3e]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- サーバーを再稼働
-- 週末 [[RMeCab]] の NgramDF() 関数と NgramDF2() 関数の出力が一致していないとの指摘を受けた．研究室引っ越し作業が一段落したので，ソースを見直すと，変数名を間違えるという，とんでもないポカをしていた． 
-- 今日明日，Rの新しいバージョンR-2.9.1 が出るのは分かっているのだが，R-2.9.1用の [[RMeCab]] バイナリを作成して公開しておく．
-午後。第2章食堂。Special。メンチカツ。ほかにも何かあったような気がするが忘れた。
-- [[RMeCab]] 0.83 を公開。これは R-2.9.1 で作成したので、つい今しがた release された R-2.9.2 用のバイナリは、また別に作成しなければいけない。

* 2009 年 8 月 23 日（日）晴 [#o08aedc0]
- 午後
-- 11:30 - 18:15 研究室移転作業に立ち会う．
-- 業者任せかと思いきや，意外にも，あれこれ荷物運びをすることがあり，かなり消耗する．

* 2009 年 8 月 22 日（土）晴 [#e724ed3e]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を終える
- 午後
-- 夕方からサーバーを落とす．IPを変更し，DNSの設定も変える． 

* 2009 年 8 月 21 日（金）晴 [#i78c96b2]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); 
-- S 社と &htmlinsert(amazontext,asin=1441900519,text=R Through Excel); についてやりとり．
- 午後．第二食堂ランチ．レンコンメンチカツ？
-- 


* 2009 年 8 月 20 日（木）晴 [#q4cca46b]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を続ける．サンプルの解析は JAGS + rjags で実行しているが，データは WinBUGS の形式で与えられているので，データを取り出すためだけに Wine を起動するのが，面倒．
-- 上記の本は，コード部分の解説がまるで訳されていない．やっぱり訳すべきだろう．ところが，翻訳掲載のコードコメントの内容が変である．原著者サイトからダウンロードしたコードと照らし合わせてみると，後者の方では修正されている．翻訳に掲載されたコードと，そのコメントは信用しない方がよさそう．
- 午後．第2食堂スペシャル．チキン
-- &htmlinsert(amazontext,asin=1441900519,text=R Through Excel); を眺める．図がめちゃくちゃ多い．

* 2009 年 8 月 19 日（水）晴 [#had26580]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 朝いちでネットワーク不通
--  &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を読む．
- 午後
-- 暑いさなか，電気量販店にヘッドフォンを行く．
//ATH-CKM50 2980円

-- 帰ってから &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を続ける．
* 2009 年 8 月 18 日（火）晴 [#a02eaafa]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- WinBUGS では2変量正規の分布のデータを与える場合，data に対して，単純にリストを二つ与えればいいようだが，JAGSでの与え方がよく分からない．それぞれ別々に与えて分析する手もあるが，同時に実行したい．
-- WinBUGS にあるスカラー値を返す rank(), ranked() も JAGS では挙動が違う．WinBUGS 1.4 マニュアルによれば

 rank(v, s)  # number of components of v less than or equal to v_s
 ranked (v, s)  # the s_th smallest component of v

//ATH-CKM50

-午後
-- 15:00から16:30までテキストマイニングに関する会議


* 2009 年 8 月 17 日（月）晴 [#y50ff316]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- s社に書類送付．
- 午後．第２食堂．鳥のフリッター？
-- rjags のモデルで初期値に0.5を与えたら

 d = c(0.5, 0.5)

エラーが出た．

 Current value is inconsistent with data

モデル的には問題ないはずなのになぁ，と思って，何気なく以下のように変更したら通った．

 d = c(.5, .5) 


* 2009 年 8 月 16 日（日）晴 [#jfa0c1b2]
- 特に変わったことなし
-- 充電

* 2009 年 8 月 15 日（土）晴 [#r8320445]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 担当すると決めたわけではないが，&htmlinsert(amazontext,asin=0387922970,text=Bayesian Computation with R ); を少し訳してみる．

* 2009 年 8 月 14 日（金）晴 [#h8b3df25]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 引き続き &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を読む．
- 午後
-- R 2.9.2 Scheduled for August 24, 2009　という通知が来た．またバージョンアップか．
-- &htmlinsert(amazontext,asin=0387922970,text=Bayesian Computation with R ); を改めて眺める．読むだけでは感触がつかめないので，少し訳したりしている．
-- &htmlinsert(amazontext,asin=1441900519,text=R Through Excel); も出たようだ．これは，さくっとできそう．

* 2009 年 8 月 13 日（木）晴 [#l440d4e9]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 研究室の整理もおおむね終わったので，昨日の片付けをして，ラボに向かう．
-- Dynamic Objective-Cのメソッドパッシングというのがよく分からないので，&htmlinsert(amazontext,asin=4861006414,text=Dynamic Objective-C); を読む．メソッドパッシングという言葉自体は出てこないのだが，｢メソッドとは何か｣以降に詳しく書いてあって，非常にわかりやすい．
---関連して、[[こんなページ:http://homepage.mac.com/mkino2/spec/optimize/methodCall.html]]見つけた
- 午後．近くのスーパーで弁当．
-- &htmlinsert(amazontext,asin=4320056787,text=生態学のためのベイズ法); を読む．これは和書の中では，初心者にも非常に取っつきやすい本だろう．ただ Ubuntu/Mac 上で rjags を使っているものからすると，[[サイト:http://arcue.botany.unimelb.edu.au/bayescode.html]]のデータは使いにくい．WinBUGS のデータ形式なのである．それに，掲載コードに少し間違いがある．
-- さらに rjags 独特の面倒もある．WinBUGS なら，以下のように書けるが，rjags では Y　が再定義されたと怒られる．
 Y [i] <- log( C3 [i] + 1)
 Y [i] ~ dnorm (mean [i] , prec)
なので，これを回避すべく，たとえばモデル定義で

 data = list( LONG = dat$LONG, LAT = dat$LAT, C3 = dat$C3, 
              Y = log(dat$C3 + 1 )),

などとしなければならない．
そのほか，任意のxに対する予測値yをシミュレートするにも，若干コードを書き直す必要がある．


* 2009 年 8 月 12 日（水）晴 [#ud78e8f8]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 研究室の片付けを今日中に終えるべく，途中，水を飲むだけで，夕方17時までぶっ通しで作業する．
-午後
-- 17:00 作業終了．いくつかの書類を整理しなければならないが，まあ，95%　作業が完了した．
-- 阿波踊りが始まったので，18時過ぎると街が混み合ってくる．その前に自宅に帰る．

* 2009 年 8 月 11 日（火）快晴 [#jd64a8d4]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- いよいよ引っ越しも佳境に入ってきた
-- サーバーを旧研究室に仮移転
- 午後．工学部食堂．スペシャル．カツの卵とじ？

* 2009 年 8 月 10 日（月）大雨 [#gb39f95b]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 総合科学部と工学部を挟む道路が水没してしまっており，ラボへ渡ることができない．
-- 仕方ないので，移転の準備をする．
-午後．工学部食堂でスペシャル．味噌カツ．さすがに誰もいない．


* 2009 年 8 月 9 日（日）大雨 [#w88a0e75]
-　大雨で，かつ蒸し暑い．

* 2009 年 8 月 8 日（土）晴 [#m9d3123a]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- オープンキャンパス準備
- 午後
--　オープンキャンパス
-- Apple社の担当者を交えて慰労会．

* 2009 年 8 月 7 日（金）晴 [#a0790e4f]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
--　「文系数学」最後の授業
- 午後．来客と食事
-- iPhone関連企画
--明日のオープンキャンパス準備
* 2009 年 8 月 6 日（木）雨 [#cd0158e1]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 移転に向けた作業を少しずつ行う
-- 出版社が送ってきてくれた原書に目を通す．
- 午後
--オープンキャンパス準備

* 2009 年 8 月 5 日（水）晴 [#x63091d8]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 移転に向けた作業を少しずつ行う
--　iPhone関連の作業を同僚と続ける．別の同僚がサーバーやWebの管理をしてくれるはずだったのだが，実はサーバー等の知識がないことが判明し，結局，私がやった．
-午後
-- 出版社から相談のメール．
--　充電 

* 2009 年 8 月 4 日（火）晴 [#s159b6be]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 朝から，インストールしたばかりの Ubuntu 9.04の設定。開発環境を入れ，TeX を入れ，R　を入れ，MeCab を入れ，VMpalyer を入れ，次に VMPlayer 上に XP, 同じく開発環境を整備する．
- 午後



* 2009 年 8 月 3 日（月）曇・雨 [#e9d26984]
-- 06:00 起床
-- 07:30 研究室着
- 午前
-- 出版社と新しい本についてやりとり．
-- Ubuntu 9.04 をインストールしようとしたら，CD　が壊れていた．．
- 午後．Apple社の方と面談の予定．その前にK氏と食事に出る．
-- Ubuntu + USB無線Lan子機 + WPA2-PSK(AES)認証がうまくいかない。USB 機器は認識しており、周囲の無線も拾っているので、認証の問題だと思うのだが、GUI無線Manager　や wpa_supplicant.config など、あれこれ試すも、接続に至らない。 

---etc/network/interfaces

 auto lo
 iface lo inet loopback
 
 auto rausb0
 iface rausb0 inet dhcp
 wpa-driver wext
 wpa-conf /etc/wpa_supplicant/wpa_supplicant.conf


--- wpa_supplicant.conf

 ctrl_interface=/var/run/wpa_supplicant
 ap_scan=2
 network={
	ssid="hogehoge"
	#psk="hogehoge"
        psk=123456789...abcdef1234
	key_mgmt=WPA-PSK
	proto=RSN
	pairwise=CCMP
	group=CCMP
 }

--- WEP接続にしてしまえという誘惑に駆られる。
//http://tycho.jp/modules/pico/computer/open/gwireless.html
//http://itpro.nikkeibp.co.jp/article/COLUMN/20060228/231136/
-- それにしても暗号化の種類、多すぎる。[[ここ:http://bogus.jp/wp/?p=419]]に手短にまとまっていた。
//http://suijackdo.seesaa.net/article/119650068.html
//http://blog.goo.ne.jp/atlanto/e/a4346471a2b2fc0c95bb402fec8bde71

* 2009 年 8 月 2 日（日）晴 [#qace510b]
-自宅

* 2009 年 8 月 1 日（土）曇・雨 [#e9d26984]
-- 05:30 起床
-- 07:00 研究室着
- 午前
-- 大学の雑用を片付ける