アールメカブ

過去の日録

Lattice Multivariate Data Visualization with R

_ 2009年 6月 30 日 (火) 雨

• 06:00 起床
• 07:25 研究室

• 午前
  • 昨日の iPhone で 後からaddSubview　した　View の件．

newView.autoresizesSubviews = YES;
newView.autoresizingMask = (UIViewAutoresizingFlexibleWidth |
         UIViewAutoresizingFlexibleHeight);
[self.view addSubview:newView];

で縦横の比率を iPhone の向きと調整してくれる．

• 工学部の事務から JABEE 関連の書類を出せといってきた．

• 午後
  • clive_mitter_ffmpeg_avidemux をメインマシンに導入
  • R_Lattice校正に関する連絡が来た．

_ 2009年 6月 29 日 (月) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • しばらくネットワークにつなげないので，また部局の DNS が落ちているんだろうと思っていたら，自分のPCのDNS設定が消えていた．いや，正確にはルータ経由でドメイン検索ができないので，マシンの側で DNS を直に指定する必要がある．利用中に突然そうなった理由が分からん．
• 午後
  • iPhone で 後からaddSubview　した　View には

[willRotateToInterfaceOrientation:toInterfaceOrientation
duration: duration] 

が効かない。

[[[self subviews] lastObject] 
   willRotateToInterfaceOrientation:toInterfaceOrientation
duration: duration]　

は効くだろうか？

_ 2009年 6月 28 日 (日) 晴

_ 2009年 6月 27 日 (土) 曇

• 07:00 起床
• 08:15 研究室

• 午前
  • R-2.9.1 がreleaseされたそうだが，筑波CRANにはまだソースが登録されていなかった．なので本家から取得． http://cran.r-project.org/src/base/R-2/R-2.9.1.tar.gz
  • とりあえず RMeCab と RCaBoCha の動作確認はできた．Linux, Windows XP , Vista とも正常に動作．例によって Mac 版は筑波 CRAN にはまだ登録されておらず．
• 午後．蓬莱

_ 2009年 6月 26 日 (金) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• libssl0.9.8 openssl アップデート

• 午前
  • 「文系のための数学」
• 午後．来客と食事
  • iPhone/iPod で View を回転させる際，View 上のコントロールを個別に処理する方法を検討．

_ 2009年 6月 25 日 (木) 晴

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• libsasl2-2 アップデート

• 午前
  • 区間推定の説明をする必要があるのだが，数式をMoodleにださにゃならん．しばらく使っていなかったがmimetex は利用可能か？

#mimetex(z = \frac{\bar{x} - \mu}{\sigma / \sqrt{n}})

&mimetex(\bar{x} -1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}}); < &mimetex( \mu); < &mimetex( \bar{x} + 1.96 \frac{\sigma}{\sqrt{n}} );

• 午後.久しぶり工学部食堂で栄養定食．例によって非常にまずいが，近いし，手っ取り早い．かやくご飯と鳥フリッター，肉じゃが（肉は見あたらないが），味噌汁．

• iPhone/iPod ワーク

_ 2009年 6月 24 日 (水) 曇

• 06:00 起床
• 07:25 研究室
• gstremaer0.10アップデート

• 午前
  • iPhone/iPod の P2P接続とデータ交換の方法をおおむね把握した．
• 午後
  • 14:35-16:00 講義

_ 2009年 6月 23 日 (火) 晴

• 06:00 起床
• 07:25 研究室
• gstremaer0.10アップデート

• 午前
  • iPhone/iPod の P2P接続とデータ交換を調べる
• 午後
  • 14:35-18:00 演習

_ 2009年 6月 22 日 (月) 曇

• 06:00 起床
• 07:25 研究室

• 午前
  • iPod Touch および iPhone SDK を3.0にアップ．
• 午後．蓬莱
  • Bluetooth 接続の実験

_ 2009年 6月 21 日 (日) 曇

• 充電

_ 2009年 6月 20 日 (土) 曇

• 06:15 起床
• 07:55 研究室
• file, libmagic, tzdata, tzdata-java アップデート

• 午前
  • iPhone/iPod
• 午後
  • iPhone/iPod

_ 2009年 6月 19 日 (金) 晴

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• app-install-data-commercial アップデート．なんだこりゃ？

• 午前
  • 演習「文系のための数学」．

_ 2009年 6月 18 日 (木) 晴

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • Mac にはデフォルトで SQLite が入っている．なのでWordNet? 日本語版をiPhoneで使えるか試してみる．

_ 2009年 6月 17 日 (水) 晴

• 06:00 起床
• 07:25 研究室

• 午前
  • Mac Leopard にデフォルトで入っている mecab は辞書が UTF-16になっていることに気が付いた．
• 午後．蓬莱

_ 2009年 6月 16 日 (火) 晴

• 07:25 起床
• 09:00 研究室

• 午前
  • 科研執行のための書類が一つたまっていた．
• 午後．蓬莱

_ 2009年 6月 15 日 (月) 曇

• 06:25 起床
• 暑いので，疲れが取れない．

• 午後
• 統計数理研究所で簡単な報告をする．
  • いろいろな分野の人から意見を聞くことができ，非常に参考になる．
• 夕方の飛行機で帰宅

_ 2009年 6月 14 日 (日) 曇

• 06:25 起床

• 統計数理研究所へ出張

_ 2009年 6月 13 日 (土) 曇

• 06:25 起床
• 07:45 研究室
• firefox, xulrunner update

• 午前
  • RCaBoCha_0.20の調整．Ubuntu にインストールした VMware 上の WindowsXP で実験すると，おおむね大丈夫そうである．ただファイルを指定する際，フォルダ名を含めたパスを指定すると，その瞬間に R が落ちることがある．フォルダ名指定を外すと問題ない．妙だな．フォルダ名取得に問題があるのだろうか？ Linux では全然問題ないのだが． そこで Windowsパソコン３台を引っ張り出し，WindowsXP，Vista それぞれで試すが，正常に動作し，何の問題はない．どうやら Ubuntu 上のバーチャルマシンでの問題らしい．利用できるメモリに問題だろうか．しかし，試用した３台のWindowsパソコンのうち，一つはスペックの貧弱なミニノートだったが，データ大きくなるとさすがに解析に時間がかかったが，それでも落ちはしない．どうも Vmware上のファイルシステムの問題のような気もする．
• 午後
  • Mac OS X 版RCaBoCha _0.20の準備．Boost をソースから入れる． とりあえず boost_1_33_1 を入れておく boost-jam-3.1.13 もダウンロードし，解凍後，ディレクトリを移り

$ ./build.sh

を実行すると MacOX86用の bjam がコンパイルされるので，これを boost_1_33_1を解凍したディレクトリにコピーし，

$ ./bjam -sTOOLS=darwin stage

を実行する．Python のパスは PYTHON_ROOT が

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.4

PYTHON_LIB_PATH が currently

PYTHON_INCLUDE_PATH が

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.4/include/python2.4

と自動的にセットされた．Python を使うことはないのだが，バージョンは適切なのだろうか？

$ ./bjam -sTOOLS=darwin install
$ sudo cp -r boost_1_31_1/boost /usr/local/include

• Mac で RCaBoCha_0.20 をコンパイルし，使ってみる．問題なさそうだ．

_ 2009年 6月 12 日 (金) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • 文系のための数学．今日も担当ではないが，一応，教室には出向く．が，内職．Boost_library を利用した CPP ソースを Windows 上でコンパイルすることを試みる．特に問題なし．
• 午後
  • R 用のCPP ファイルにBoost を含めるのだが，Linux や Mac ではコンパイルできるが，mingw on Windows では

mingw32/4.2.1-sjlj/include/c++/3.3/bits/codecvt.h:110:52:
 macro "length" passed 4 arguments, but takes just 1

のエラー．これまで cpp の stream 系は用心深く避けてきた．ここで紹介されているような典型的なエラーがあるからである．しかし，今回のはエラーはつぶすのがやっかいそうだ．

• やっかいそうだなと思ったのだが，

#include<boost/tokenizer.hpp>

の位置を，R 関連のヘッダよりも上に移動したら，あっさりコンパイラが通った．改めてググってみると，同様の回答があった．

_ 2009年 6月 11 日 (木) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• libaprutil1 update

• 午前
  • 重版の連絡．
• 午後．工学部
  • vmware-config.pl 再実行．Kernel のバージョンアップ後，一度も実行していなかったらしい．

_ 2009年 6月 10 日 (水) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• libmagick10 update

• 午前
  • よそ様のサーバーの設定を調整してあげる．ごちゃごちゃしていたり，抜けていたりと，思ったよりも手間取った．
• 　午後
  • 　14:35-16:00　講義
  • Firefox に欧米語インライン機能をつける。about:config で layout.spellcheckDefault を2に設定.これで1行テキストフィールドでも使えるようになる。ただし辞書を追加する必要がある。Googleの検索入力欄あたりで右クリックし、メニューの辞書の追加をクリックして、適当にインストールする。

_ 2009年 6月 9 日 (月) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • 大学院授業資料の準備
• 午後
  • 14:35-17:00 演習

_ 2009年 6月 8 日 (月) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • RCaBoCha を大幅に修正した．来週後半以降，公開する．
• 午後
  • boost/tokenizer.hpp のプログラムチェック．使えそう．

_ 2009年 6月 7 日 (日) 晴

• 充電

_ 2009年 6月 6 日 (土) 曇

• 06:45 起床
• 08:15 研究室
• pm-utils update

• 午前
• RCaBoCha 実装

_ 2009年 6月 5 日 (金) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室

• 午前
  • 08:35-10:10 まで「文系のための数学」担当
  • Mac 版 ESS で R を起動したらローケルが C になっている． emacs.elに以下を追記したら，日本語で起動できた．しばらく Mac でESS を使っていなかったのだが，以前は，以下2行はなくとも日本語モードで起動したような気がするのだが．

    (set-locale-environment "utf-8")
    (setenv "LANG"  "ja_JP.UTF-8")

ついでに ESS 上では

options(device = "quartz")

と指定する．

• 午後．来客と食事

_ 2009年 6月 4日 (木) 曇

• 05:45 起床
• 07:15 研究室
• cups, purple, pidgin アップデート有り

• 午前
  • RMeCab のメモリ回りを調整

_ 2009年 6月 3日 (水) 雨

• 06:00 起床
• 07:30 研究室

• 午前
  • synaptic で libboost-dev libboost-dbg をインストール．
  • CaBocha? のインターフェイスを使ったコードでmbstowcsを使っているのだが，文字列が長くなると buffer overflow detected となるローケルを C にセットすればいいのだが，そうすると，それ以降の実装で問題が生じる．う〜ん，実装を見直すか．．．
• 午後
  • 14:35-16:05 講義
  • CaBoCha インターフェイスのbuffer overflow 問題解決．つまらないところを見落としていた．

_ 2009年 6月 2日 (火) 晴

• 06:00 起床
• 07:30 研究室
• cron update

• 午前
  • 金先生の著作のコードを使って igraph_0.5.2-2 のネットワークを描こうとすると，次のエラーに遭遇した．

[tcl] bad screen distance "R_call 0xa4bd9d4 2.122e-314raph".

tcl/tkは8.5なのだが，サンプルコードなどは動くので，どうやらこのバージョンの igraph ではコードに修正が必要なようだ．金先生のコードに関しては，単に vertex.size=1 を省けば描画された．

• 午後
  • 14:35-16:05 演習
  • RCaBoCha の開発に入る．

_ 2009年 6月 1日 (月) 晴

• 06:00 起床
• 07:30 研究室

• 午前
  • 久しぶりに「論文」にシフト
• 午後．蓬莱小．若い人が調理してくれたが，いまいち．
  • igraph パッケージを使おうと思ったら，Tcl.Tk が無いと言われる． Synaptic からインストールして，R をコンパイルし直す．Tck Tk をサポートした R バイナリだと，install.pacakgesを実行するたびに，レポジトリを指定するウィジェットが起動する．.Rprofile に以下を追記．

options(repos="http://cran.md.tsukuba.ac.jp")

• emacs.ubuntu.8.10.Atok.el の設定を変更